El uniforme titular siempre llevó los mismos colores que su escudo y ubicados en la misma posición (rojo a la derecha y negro a la izquierda). En el año 1981, durante un polémico partido contra Boca Juniors y sabiendo que el descenso de categoría era inminente, Colón decide jugar el segundo tiempo con una inusual camiseta a rayas celestes y blancas. Ésta decisión fue adoptada con el fin de no descender utilizando los colores rojo y negro (en palabras del propio presidente de Colón en ese entonces).

En 1985, mientras Colón disputaba el torneo de Segunda División, los colores de la camiseta titular fueron invertidos, quedando el negro a la derecha y el rojo a la izquierda. Colón tuvo dos camisetas de edición especial, una en 2005 en conmemoración de los 100 años de la institución, diseñada por la marca Puma; y la otra en el año 2014 diseñada por la marca Umbro, en conmemoración a la leyenda de «El Cementerio De Los Elefantes», al cumplirse 50 años de la mítica victoria de Colón frente al Santos de Pelé.